De locatie van een hotel in Kumamoto bepaalt sterk de ervaring van je verblijf. De meeste toeristen kiezen ervoor te verblijven in het centrum van Kumamoto, rond het station Kumamoto en het stadscentrum. Dit gebied biedt gemakkelijke toegang tot het Kumamoto-kasteel, winkels, cafés en openbaar vervoer. Ideaal voor toeristen en zakenreizigers die vlakbij de belangrijkste attracties en transportknooppunten willen zitten.
Een andere interessante wijk is de omgeving van de Suizenji Jojuen tuin, wat rustiger is en zich leent voor reizigers die ontspanning zoeken en toch binnen handbereik van het centrum willen zijn. Gezinnen en stellen die een aangenamere en minder drukke sfeer zoeken vinden deze locatie aantrekkelijk.
Voor budgetreizigers en backpackers zijn er guesthouses en hostels verspreid over de stad meer buiten het centrum, waar kosten lager liggen, maar de reistijd naar attracties iets langer kan zijn. Zakenreizigers kunnen ook kiezen voor hotels nabij het bedrijfsdistrict rondom het station, dat vaak goede voorzieningen zoals vergaderzalen heeft.
